深度价内权证是指那些权证价格远远低于理论价值的权证，比如五粮ＹＧＣ1、马钢ＣＷＢ1和武钢ＣＷＢ1，截至1月11日，上述三只权证的折价率分别达到13．2％、12．7％和15．6％，均属于深度价内权证。
深度价内权证出现的主要原因是投资者不认可权证的理论价格，认为权证的价值已经体现在现有的价格中，不存在明显的套利机会。以五粮ＹＧＣ1为例，根据1月11日的收盘数据来计算，其理论价格为57．194元，内在价值为40．752元，时间价值为7．938元，剩余期限为81天，实际杠杆比率仅为1．314。投资者并不认为在未来的81天内，该权证可以实现相应的时间价值，因为高额的内在价值付出的成本也相对较高。因此，深度价内的权证的折价率一般长期存在，并且流通性较差，换手率较低。
投资深度价内权证还存在着一定的风险：第一，深度价内的权证价格一般较高，一旦出现不利的市场走势，亏损绝对值比较大，这完全违背了权证亏损有限的优势；第二，现有的折价率较高的权证一般以证券给付的方式结算，这会增加正股股本，降低权证与正股之间套利的可能性，以马钢ＣＷＢ1为例，该权证发行量为12．65亿份，而该权证的正股总股本为64．6亿，流通股本仅为8．92亿，这必定让持有权证行权以套利可能性大大降低。对于长期看好正股走势的投资者来说，投资这类低杠杆比率的深度价内权证并没有明显的优势；第三，就目前的市场来看，权证市场的活跃程度远小于股票市场，这反映了投资权证资金的犹豫，这也加大了这类深度价内权证波动的系统性风险。
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